El Herbario de la Universidad del Quindío (HUQ) fue creado en 1985 por un grupo de aficionados que se dedicaron a recoger muestras de las especies botánicas del departamento y sus alrededores.

Con el paso del tiempo, la iniciativa tomó fuerza, y ahora el Herbario está asociado al programa de biología de la Universidad, a la Maestría en Diversidad Vegetal y al naciente Doctorado de Ciencias, que tendrá énfasis en biología. Además, recientemente fue incluido en la lista de los diez herbarios más grandes de Colombia según el número de especímenes montados y almacenados.

Además de los ejemplares botánicos como tal, el HUQ custodia algunas colecciones accesorias, cuyos ejemplares están asociados con los del Herbario. Carpoteca (frutos), xiloteca (maderas), antoteca (compuestos florales) y palinoteca (polen) completan el valioso patrimonio que se aloja en este Herbario.

El objetivo principal, además de los fines académicos, es el estudio y la preservación de la flora de toda la región centro andina de Colombia. Para las investigaciones relacionadas con esta misión, cuenta con cuatro reservas en el Quindío cuya administración está adjudicada a la Universidad.